Введение: проведен анализ заболеваемости детей 5-9-летнего возраста за период 2016-2018 гг. с определением ведущих патологий в Российской Федерации и в Федеральных округах. Целью исследования стало изучение заболеваемости детей 5-9-летнего возраста с определением ведущих патологий в Российской Федерации и в Федеральных округах. Методы и материалы исследования: источником информации послужили форма статистического наблюдения №12 «Сведения о числе заболеваний, зарегистрированных у пациентов, проживающих в районе обслуживания медицинской организации» и Бюллетень «Численность населения Российской Федерации по полу и возрасту» Федеральной службы государственной статистики по состоянию на 01 января исследуемого года. Результаты: в ходе исследования выявлено, что лидирующие место в структуре заболеваемости данной возрастной группы занимают болезни органов дыхания (58,49% и 58,41%), на втором месте находятся болезни органов пищеварения (5,84% и 5,30%) и на третьей позиции болезни глаза и его придаточного аппарата (5,20% и 5,33%). Неблагоприятным фактором является рост травм среди детей данной возрастной группы (на 10,40%), а также болезней органов пищеварения (на 2,53%), что может свидетельствовать о проблеме формирования правильных пищевых привычек и здоровьесберегающего поведения. Заключение: ранжирование классов болезней по Федеральным округам позволило выявить территориальные особенности заболеваемости детей 5-9 лет, что может послужить основой для разработки региональных профилактических программ для детей дошкольного и младшего школьного возраста.