Введение. Микробиоценоз слизистых оболочек дыхательных путей представляет собой мощный естественный противоинфекционный барьер при COVID-19. Коронавирусная инфекция угнетает факторы естественного иммунитета, что вызывает нарушение ассоциативных связей в микробиоте. Изучение данной проблемы особенно важно в аспекте старшей возрастной категории. Цель работы - изучить возрастные особенности микробиоценоза нижних дыхательных путей, коррелирующие с исходами COVID-19. Материалы и методы: Для оценки возрастных изменений, в исследование был включён 812 человек и выделены три группы в зависимости от возраста. Всего было исследовано 1394 микроорганизма. Результаты исследования: Микробный пейзаж респираторного тракта при исследовании у лиц с коронавирусной инфекцией до начала лечения представлен следующими микроорганизмами: Streptococcus, Neisseria, Staphylococcus, Corynebacterium non diphtheriae, Enterococcus, Moraxella, Haemophilus, Pseudomonas, Acinetobacter, Escherichia, Proteus, Klebsiella, Enterobacter, Citrobacter, Stenotrophomonas, Morganella, Candida, Penicillium, Mucor. При сравнении частоты обнаружения микроорганизмов у лиц, находившихся в стационаре менее 14 дней с пациентами, срок госпитализации которых превышал 15 дней, было получено, что статистически значимо, у первых, реже встречались Candida albicans и Corynebacterium spp при p=0,015, а Enterococcus faecalis чаще. Обсуждение: Состав микробиты у двух групп был общим, за исключением отсутствия таких родов, как Proteus, Pseudomonas, Moraxella, Haemophilus в группе лиц, нахождение в стационаре которых было более 15 дней и Morganella, которая не была обнаружена в группе лиц, срок госпитализации, составляющий менее 14 дней. Заключение: Длительность пребывания в стационаре и неблагоприятный исход при коронавирусной инфекции характеризуется выявлением колонизации более агрессивной микрофлорой при поступлении, а также уменьшением обнаружения полезных представителей комменсальной микробиоты, что особо выражено среди лиц старше 60 лет.