Актуальность. Проблема стандартизации показателей, отражающих эпидемическую ситуацию по туберкулёзу (ТБ) и ВИЧ-инфекции, в учреждениях уголовно-исполнительной системы (УИС) является актуальной по причине существенных возрастно-половых отличий подозреваемых, обвиняемых и осуждённых (ПОО) от населения в целом, быстрым изменением этой структуры во времени. Материалы и методы. Возрастно-половая численность ПОО изучалась на основании формы № ФСИН-1, численность впервые выявленных больных туберкулёзом по полу и возрасту изучалась на основании данных формы Росстата № 8, численность впервые выявленных случаев ВИЧ рассчитывалась на основании данных формы Росстата № 61. Плотность ПОО на год возрастной группы рассчитана как отношение числа ПОО в соответствующей возрастной группе к числу возрастов в этой группе. Для стандартизации нами использован европейский стандарт населения, раздельно для мужчин и женщин. Результаты. Стандартизация показателей включала этапы: 1) расчёт ожидаемой численности ПОО (раздельно мужчин и женщин) в каждой из возрастных групп, комплементарных данным форм №№ 8 и 61; 2) расчёт возрастных коэффициентов заболеваемости ТБ и ВИЧ раздельно для мужчин и женщин; 3) адаптация европейского стандарта населения к возрастным группам, приведённых в формах №№ 8 и 61; 4) расчёт стандартизованных показателей заболеваемости и стандартизованного числа ПОО больных ТБ и ВИЧ мужчин и женщин; 5) расчёт ожидаемого числа вновь арестованных мужчин и женщин и стандартизованного показателя заболеваемости ТБ и ВИЧ мужчин и женщин, стандартизация заболеваемости ТБ и ВИЧ по полу; 6) анализ полученного динамического стандартизованного ряда по сравнению с показателем заболеваемости в целом по России. Различия между стандартизованными и нестандартизованными показателями заболеваемости ТБ существенны. Хотя направление их динамики сходно, коэффициент независимой переменной, отражающий наклон уравнения регрессии у нестандартизованного показателя меньше. Стандартизация показателя заболеваемости болезнью, вызванной ВИЧ, и бессимптомным ВИЧ-статусом не даёт дополнительной информации для анализа; стандартизованный и нестандартизованный показатели и их динамика близки; различия возрастной структуры не оказывают существенного влияния на показатель заболеваемости ВИЧ. Заключение. Рекомендуется проведение стандартизации для анализа динамики заболеваемости ТБ. Проведение стандартизации для болезни, вызванной ВИЧ и бессимптомного ВИЧ-статуса ВИЧ не целесообразно.